Τον Δεκέμβριο του 2006 ο Σωτήρης Νίνης υπέγραψε το πρώτο του επαγγελματικό συμβόλαιο με την ομάδα του Παναθηναϊκού.

 

Περίπου ένα μήνα αργότερα πραγματοποίησε την πρώτη του εμφάνιση με τους «πράσινους» και έγινε ένας από τους νεότερους ποδοσφαιριστές που φόρεσαν τη φανέλα με το «τριφύλλι».

 

Οι εντυπώσεις από το ντεμπούτο του στη «μεγάλη» κατηγορία ήταν άκρως ενθαρρυντικές, παρουσιάζοντας έτσι, μια πρώτη γεύση από το τι θα ακολουθούσε.

 

 

Είκοσι ημέρες μετά, ο νεαρός μέσος πέτυχε το πρώτο του τέρμα, χρήζοντας τον εαυτό του, τον δεύτερο νεότερο ποδοσφαιριστή που έχει σκοράρει στην Α'΄Εθνική. Αυτό ήταν! Σε ένα διάστημα ούτε δύο μηνών έγινε γνωστός στο ποδοσφαιρικό κοινό και όλα ξεκίνησαν κάπως έτσι.

 

Η καριέρα του από εκεί και έπειτα γνώρισε μεγάλη άνθιση και δεν άργησαν να εμφανίζονται δειλά-δειλά μνηστήρες για την απόκτησή του. Η κορύφωση της ποδοσφαιρικής του καριέρας ήρθε την περίοδο 2009-10, στο δεύτερο κατά σειρά ματς με τη Ρόμα για το Europa League, στο οποίο κέρδισε πέναλτι, είχε μία ασίστ, ενώ πέτυχε και ένα πολύ όμορφο γκολ.

 

Ελληνικά και ξένα ΜΜΕ είχαν επικεντρωθεί στο πρόσωπό του εκείνο το διάστημα και όλο και διευρυνόταν το «μέτωπο» των συλλόγων που έδειχναν ενδιαφέρον. Για κακή του τύχη, όμως, στο ματς της εθνικής ομάδας με το Ισραήλ, υπέστη μερική ρήξη χιαστών, τραυματισμός που θα τον ανάγκαζε σε εξάμηνη απραγία.

 

Κατά τη διάρκεια της αποθεραπείας του, έγινε γνωστό το ενδιαφέρον της Πάρμα. Ο ιταλικός σύλλογος ολοκλήρωσε τη συμφωνία με τον παίκτη του «τριφυλλιού» και ο «El ninio» από το καλοκαίρι δεν θα βρίσκεται στην Παιανία.

 

Το τέλος της κανονικής περιόδου της Super League βρήκε τον Σωτήρη Νίνη να συμπληρώνει 100 συμμετοχές με τη φανέλα του Παναθηναϊκού, γνωρίζοντας, βέβαια, πως μετά το τέλος και των πλέι οφ θα αποχαιρετήσει τους συμπαίκτες του, έχοντας ως επόμενο ποδοσφαιρικό σταθμό την ομάδα της Πάρμα.